En el dictamen de creación del ITRANS se prevén las líneas de investigación que habrá de desarrollar como son:
- Biología molecular, genómica y proteómica.
- Bioinformática.
- Sistemas robotizados y automatización de procesos industriales.
- Inteligencia artificial.
- Modelación y matemáticas aplicadas en sistemas complejos.
- Materiales avanzados.